國家研究中心是適應大科學時代基礎研究特點的學科交叉型國家科技創新基地，是國家科技創新體系的重要組成部分。
　　序號
　　中心名稱
　　實驗室代碼
　　依托單位
　　中心主任
　　1
　　北京分子科學國家研究中心
　　2003DB105050
　　北京大學，
　　中國科學院化學研究所
　　席振峰
　　張德清
　　2
　　北京凝聚態物理國家研究中心
　　2003DB173010
　　中國科學院物理研究所
　　方忠
　　3
　　沈陽材料科學國家研究中心
　　2000DB173010
　　中國科學院金屬研究所
　　盧柯
　　4
　　合肥微尺度物質科學國家研究中心
　　2003DB173020
　　中國科技大學
　　羅毅